水淹车的鉴定费用因车辆价值的不同而有所差异。以下是一个大致的收费标准：
标的物鉴证总值不超过1万元
鉴证总值在2000元（含2000元）的，按50元标准收取。
鉴证总值在2000元至5000元（含5000元）的，按150元标准收取。
鉴证总值在5000元以上的，按3%计算据实收取。
标的物鉴证总值1万元至10万元（含10万元）
1万元部分按3%收取。
超过1万元部分按2%收取。
标的物鉴证总值10万元至20万元（含20万元）
1万元部分按3%收取。
1万元至10万元部分按2%收取。
超过10万元部分按1%收取。
标的物鉴证总值超过20万元
20万元以内部分按上述第3款的规定收取。
超过20万元部分按0.5%收取。
此外，对于鉴定费用的承担问题，也需要根据具体情况来判断：
交通事故中的车辆鉴定：根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，如果车辆是在交通事故中被水淹，公安机关交通管理部门需要对事故车辆进行鉴定以收集证据，那么这部分鉴定费用应由公安机关承担。
非交通事故中的车辆鉴定：如果车辆是在非交通事故情况下被水淹，例如停放在易受水淹的区域内，那么鉴定费用的承担可能需要根据当地相关法规或停车场的规定来确定。在某些情况下，停车场或物业公司可能需要对车辆的损失承担一定责任，因此他们可能会承担部分或全部鉴定费用。但这通常需要通过法律程序来确定责任归属。
车主自行委托鉴定：如果车主自行委托第叁方机构进行车辆鉴定，那么鉴定费用通常需要由车主自行承担。
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